Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx4Q6P1D7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms