Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Soga3Q6NZL0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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