Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rprd2Q6NXI6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rprd2Q6NXI6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms