Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frem2Q6NVD0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms