Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms