Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cep78Q6IRU7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cep78Q6IRU7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms