Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ParpbpQ6IRT3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms