Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Krt40Q6IFX3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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