Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw2Q6I6G8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw2Q6I6G8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms