Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg9bQ6EBV9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg9bQ6EBV9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms