Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Scaf8Q6DID3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scaf8Q6DID3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms