Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbf1Q6DFZ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms