Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q6DFW0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q6DFW0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6DFW0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6DFW0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms