Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rftn1Q6A0D4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms