Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk13Q69ZA1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdk13Q69ZA1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms