Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Papd5Q68ED3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms