Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zeb1Q64318 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zeb1Q64318 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms