Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pan3Q640Q5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pan3Q640Q5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Pan3Q640Q5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Pan3Q640Q5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pan3Q640Q5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pan3Q640Q5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pan3Q640Q5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pan3Q640Q5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pan3Q640Q5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pan3Q640Q5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pan3Q640Q5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pan3Q640Q5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pan3Q640Q5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms