Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f3Q63955 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou4f3Q63955 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms