Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tff3Q62395 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff3Q62395 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff3Q62395 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms