Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp1Q62209 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sycp1Q62209 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms