Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Trim27Q62158 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Trim27Q62158 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Trim27Q62158 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Trim27Q62158 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim27Q62158 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim27Q62158 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim27Q62158 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim27Q62158 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim27Q62158 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim27Q62158 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim27Q62158 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim27Q62158 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim27Q62158 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim27Q62158 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim27Q62158 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim27Q62158 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim27Q62158 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim27Q62158 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim27Q62158 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim27Q62158 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim27Q62158 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim27Q62158 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim27Q62158 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim27Q62158 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim27Q62158 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim27Q62158 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
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