Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Npm1Q61937 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm1Q61937 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms