Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg2Q61878 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms