Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HlxQ61670 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HlxQ61670 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms