Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usf1Q61069 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usf1Q61069 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usf1Q61069 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usf1Q61069 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usf1Q61069 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usf1Q61069 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usf1Q61069 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usf1Q61069 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf1Q61069 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usf1Q61069 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms