Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp7Q60973 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms