Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep250Q60952 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep250Q60952 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep250Q60952 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep250Q60952 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep250Q60952 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep250Q60952 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Cep250Q60952 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep250Q60952 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep250Q60952 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep250Q60952 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cep250Q60952 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cep250Q60952 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cep250Q60952 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cep250Q60952 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cep250Q60952 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep250Q60952 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep250Q60952 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep250Q60952 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cep250Q60952 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep250Q60952 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep250Q60952 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep250Q60952 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep250Q60952 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep250Q60952 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep250Q60952 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms