Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac3Q60931 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac3Q60931 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac3Q60931 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms