Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf3Q60803 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms