Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms