Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdkn2cQ60772 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms