Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfaip3Q60769 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfaip3Q60769 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfaip3Q60769 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfaip3Q60769 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfaip3Q60769 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfaip3Q60769 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfaip3Q60769 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfaip3Q60769 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfaip3Q60769 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfaip3Q60769 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfaip3Q60769 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfaip3Q60769 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfaip3Q60769 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfaip3Q60769 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms