Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sik1Q60670 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sik1Q60670 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms