Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Sin3aQ60520 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sin3aQ60520 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms