Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms