Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Brip1Q5SXJ3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms