Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctc1Q5SUQ9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms