Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Sco1Q5SUC9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Sco1Q5SUC9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Sco1Q5SUC9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Sco1Q5SUC9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Sco1Q5SUC9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Sco1Q5SUC9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sco1Q5SUC9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms