Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r223Q5SSA0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms