Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf215Q5SPX3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms