Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc88aQ5SNZ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms