Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg7Q5RJH6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms