Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm11487Q5RIS0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm11487Q5RIS0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms