Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1810065E05RikQ5NC41 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms