Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SynaQ5G5D5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SynaQ5G5D5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SynaQ5G5D5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms