Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eme2Q56A04 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eme2Q56A04 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms