Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc84Q4VA36 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc84Q4VA36 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms