Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a5Q4LDG0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a5Q4LDG0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a5Q4LDG0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a5Q4LDG0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a5Q4LDG0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a5Q4LDG0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a5Q4LDG0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a5Q4LDG0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a5Q4LDG0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a5Q4LDG0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc27a5Q4LDG0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms