Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brinp3Q499E0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Brinp3Q499E0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms